Une protéine recombinante est une protéine codé un transgène. Des vecteurs recombinants sont utilisés pour introduire le transgène dans le génome des celule productrices. De nombreux systèmes d’expression des vecteurs recombinants sont utilisés.
| Systèmes d’expression | Avantages | Inconvénients |
| Procaryotes | meilleur croissance, système génétique maitrisé, disponibilité des vecteurs d’expression, meilleure production des protéines… | manque de modification post-traductionnelle… |
| Levures | génome maîtrisé, capacité de production des protéines… | capacité de sécrétion des grosses protéines, protéine produite… |
| Champignons | capacité sécrétion… | modifications post-traductionnelles souvent inadéquate |
| Plantes | Transgénèse, utilisation de bactéries (Agrobacterium tumefaciens), capacité de production … | Immunogénicité, glycosylation incomplète… |
| Cellules d’insectes | meilleur croissance, capacité de production, modifications post-traductionnelles… | glycosylation incomplète, couts élevés… |
| Animaux | Synthèse de grosses proteines, modifications post-traductionnelles complète… | croissance lente, capacité de production… |